Сад тысячи цветов: Девушки-самураи

События сериала разворачиваются в вымышленной версии Японии, где сёгунат Токугавы одержал верх в гражданской войне, разгромив сторонников императора. Кроме того, власти удалось отразить вторжение западных завоевателей. В этом альтернативном мире XXI века страна живёт в условиях строгой изоляции и националистической идеологии. Неподалёку от священной горы Фудзи находится элитная академия, где готовят будущих лидеров нации. Здесь гармонично сочетаются древние боевые искусства и передовые технологии: ученики владеют как традиционными клинками и копьями, так и современными устройствами вроде смартфонов и камер. В стенах этого учебного заведения традиции прошлого встречаются с реалиями настоящего. Сёгун Есихико из рода Токугава наставляет молодых студентов, передавая им секреты боевого мастерства. Среди новоприбывших — шестнадцатилетний Мунэакира из знатного клана Ягю. Он быстро вливается в жизнь академии, восхищаясь мастерством своих наставников и постигая тонкости обращения с оружием.